CHKBiotech je uspješno razvio komplet za otkrivanje novih verzija koronavirusa

Novi soj varijantnog koronavirusa 501Y-V2 iz Južne Afrike
18. decembra 2020. Južna Afrika otkrila je mutant 501Y-V2 novog koronavirusa. Sada se južnoafrički mutant proširio u više od 20 zemalja. Eksperimenti su pokazali da iznad mutanata novog korona virusa mogu biti i druge varijacije mutacija K417N / T, E484K i N501Y novog koronavirusa koje mogu smanjiti sposobnost neutralizacije vakcinom izazvanih antitela za neutralizaciju plazme. Međutim, u usporedbi s referentnim genomom Wuh01 (sekvencijski broj MN908947), 501Y.V2 južnoafričke mutirane genomske sekvence ima 23 nukleotidne varijante. Ima istu mutaciju N501Y kao britanski mutant B.1.1.7 podtip, ali i dalje sadrži mutacije na dva ključna mjesta E484K i K417N proteina S koje imaju potencijalno važne efekte na sposobnost virusa da zarazi.

Novi koronavirus je jednolančani RNK virus, čiji su genske mutacije češće. Detekcija jedne mete može lako dovesti do propuštene detekcije uzoraka s malim virusnim opterećenjem i mutiranim sojevima virusa. Stopa preispitivanja pojedinačno pozitivnog u otkrivanju cilja može doseći više od 10%, što može povećati opterećenje i produžiti vrijeme dijagnoze. Višeciljno otkrivanje i međusobna provjera rezultata svake mete mogu povećati stopu otkrivanja i olakšati ranu dijagnozu.

news1

Slika 1. Šematski dijagram mehanizma infekcije novim koronavirusom

Novi mutant koronavirusa B.1.1.7 Britanije
26. decembra 2020. godine prvi je naučni rad soja B.1.1.7 objavljen na mreži. Institut za higijenu Univerziteta u Londonu u Velikoj Britaniji i za tropske bolesti potvrdio je da je soj B.1.1.7 sposobniji za širenje od ostalih sojeva, što je više od 56% (95% CI 50-74%). Budući da ovaj novi mutantni soj ima očigledniju prenosnu snagu, postalo je teže kontrolirati COVID-19. Sljedećeg dana, Univerzitet u Birminghamu u Velikoj Britaniji učitao je članak o MedRxivu. Studija je pokazala da je značajno povećan broj kopija gena virusa ORF1ab i N kod pacijenata zaraženih mutiranim sojem B.1.1.7 (odustajanje od S-gena); ovaj fenomen praćen je u populaciji. Ovaj članak ističe da pacijenti zaraženi mutantom B.1.1.7 iz Britanije imaju znatno veće virusno opterećenje, tako da je ovaj mutant možda i patogeniji.

1

Slika 2. Sekvencija mutacije genoma sadržana u mutiranom soju B1.1.7 koronavirusa iz Britanije

2

Slika 3. Mutacija N501Y dogodila se i u Britaniji i u Južnoj Africi Varijante

Komplet za otkrivanje novih varijanti koronavirusa
Chuangkun Biotech Inc. uspješno je razvio komplet za otkrivanje novih verzija koronavirusa B.1.1.7 i 501Y-V2.

Prednosti ovog proizvoda: visoka osjetljivost , istovremena detekcija 4 cilja, pokrivajući glavna mjesta mutacija mutantnog soja B.1.1.7 i mutiranog soja 501Y.V2 Južne Afrike. Ovaj komplet može istovremeno otkriti mjesta mutacije N501Y, HV69-70del, E484K i novi gen za koronavirus S; Brzi test: potrebno je samo 1 sat i 30 minuta od uzimanja uzorka do rezultata.

3

Slika 4. Otkrivanje britanske krivulje pojačanja COVID-19

4

Slika 5. Otkrivanje krivulje pojačanja varijante Južnoafričke Republike COVID-19

5

Slika 6. Krivulja pojačavanja novog koronavirusa divljeg tipa

Nije jasno kako ove mutacije akumuliraju novi dugoročni utjecaj pandemije COVID-19 udesno. Ali ovo nas podsjeća da ove mutacije mogu utjecati na djelotvornost prirodnog imuniteta i imuniteta izazvanog cijepljenjem. Također nas podsjeća da moramo kontinuirano dugo pratiti novi koronavirus i ažurirati COVID-19 cjepivo kako bismo se bavili evolucijom novog koronavirusa.


Vrijeme objavljivanja: ožujak 12-2021